Sublime Textのパッケージアップデートで毎回リセットされるので、
自分のテーマファイルのカスタマイズメモ。
Tomorrow-Nightの以下だけ変更。
/Packages/Theme%20-%20Phoenix/Color%20Scheme/Tomorrow-Night.tmTheme
<dict>
<key>settings</key>
<dict>
<key>background</key>
<string>#191919</string>
<key>caret</key>
<string>#00ff00</string>
<key>foreground</key>
<string>#C5C8C6</string>
<key>invisibles</key>
<string>#4B4E55</string>
<key>lineHighlight</key>
<string>#282A2E</string>
<key>selection</key>
<string>#666600</string>
</dict>
</dict>