Movable Type5の月別アーカイブのmt:Entries内でカスタムフィールドとれないっていうのにはまった。
サイトの全ページに特定ブログの最新記事リストを出力 – MTQ | Movable Type 5 ユーザーコミュニティ
にちょっとヒントがあったのだけど、
ブログのコンテキストっていうのが影響するらしい。
というわけで、
<mt:Entries blog_ids="自ブログのID">
とmt:Entriesに自ブログのIDわたして、コンテキストをきちっと指定することでカスタムフィールドの値取得できた。